土传病害是指生活在土壤中的病原菌或者土壤中病株残体中的病菌，主要危害植株根、茎，侵染维管束，由根部向茎尖发展，病原菌在维管束内繁殖，阻塞其输送营养物质，致使植株枯萎死亡，侵染病原包括真菌、细菌、放线菌、线虫等。土传病害一般危害植物的根和茎，作物生长前期一旦发生病害，幼苗根腐烂或是茎腐烂猝倒，幼苗很快就会死亡，严重影响作物生长。
常见的土传病害主要有各种蔬菜苗期的猝倒病、立枯病；瓜、果、豆类蔬菜的枯萎病；茄子等的黄萎病；茄果类蔬菜的青枯病；黄瓜、芹菜、木耳菜的根结线虫病；大白菜等的软腐病；芦笋的茎枯病；香蕉镰刀菌枯萎病以及各种果树的根结线虫病等。这些病害除了猝倒病和立枯病在幼苗期表现症状外，大部分病原在植物生长初期就已经感染，但在生长初期不表现出症状（潜伏期较长），往往到了生长中后期（开花结果期）才开始发病，并且一经发现，各种治疗措施都收效甚微，很快就导致严重后果，甚至绝收。
土传病害因病原物在土壤中能长期存活，并且数量巨大，目前常见的处理措施以土壤消毒为主，如用福尔马林、敌磺钠、石灰、硫酸铜等药剂喷洒土壤。但因土壤的分量太大，往往需要很大的用药量，才能达到一定的效果，但却很难做到彻底消毒；加上药剂的有效期只有1~2个月，药剂的有效期一过，病菌往往卷土重来，起不到应有的防治效果。但因大量施用农药，极易造成农产品农药残留超标。
如何抑制土传病害？
针对土传病害日益严重的问题，可以采取两种策略。一是继续加强化学或物理的杀灭措施，尽可能给作物创造一种无菌的条件。这是比较难的，因为土壤的结构和理化特性比较复杂，有许多因素影响灭菌效果；即便暂时能够做到，但一旦有新的病菌进入，由于缺乏自然抑制能力，就会迅速成灾。另一种策略是增加农田土壤微生物种类和数量，创造一个合理、平衡、稳定的微生物区系并依靠他们之间的竞争、占位、重寄生等关系，抑制病菌的滋长。实践证明这是持续防治病害的合理策略。
实现土壤生态平衡，抑制土传病害的发生，需要掌握好两方面：
一是增加土壤中的有机质，包括农家肥（厩肥、堆肥）、工厂化生产的有机肥、秸秆还田和种植草苜蓿等绿肥作物。有机质不仅蕴涵丰富的营养物质，使土壤形成团粒结构，还是培养各种微生物的基质。
二是补充有益微生物。我们必须明白，只有当有机物质与有益微生物同时存在时，才能起到增肥防病的效果。菌肥中含有大量土壤有益微生物，可改善作物的营养条件并分解土壤中的有机质，使其转变成能被植物吸收的养分。另一方面，微生物会产生赤霉素，会平衡根系对各种养分的吸收，使果实蛋白质、糖分、维生素含量提高，硝酸盐含量下降，品质明显改善。
